La modernisation de la ligne inclut la suppression de 9 passages à niveau (PN) le long de la voie pour lesquels des aménagements alternatifs seront réalisés :
• Trois passages à niveau bénéficieront d’aménagements de rétablissements routiers sécurisés : les PN n°60 (à Forges-les-Eaux), 41 et 42 (à Ferrières-en-Bray).
• Quatre passages à niveau (PN n°40, 47, 49, 52) bénéficieront d’aménagements de voiries latérales et le pont des Mollettes à Haussez sera aménagé pour le PN 51.
• Un passage à niveau, à Eragny-sur-Epte (PN n°26), sera remplacé par une passerelle piétonne.
